Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCGB2A2Q13296 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms