Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4F3Q08477 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms