Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFI35P80217 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFI35P80217 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFI35P80217 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFI35P80217 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFI35P80217 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFI35P80217 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFI35P80217 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFI35P80217 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFI35P80217 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IFI35P80217 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFI35P80217 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFI35P80217 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFI35P80217 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFI35P80217 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFI35P80217 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFI35P80217 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFI35P80217 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFI35P80217 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFI35P80217 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms