Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SEC24CP53992 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms