Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLP40337 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLP40337 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLP40337 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLP40337 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLP40337 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VHLP40337 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLP40337 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLP40337 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLP40337 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLP40337 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLP40337 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLP40337 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLP40337 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLP40337 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLP40337 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms