Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGAEP38570 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms