Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX1P22670 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX1P22670 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFX1P22670 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX1P22670 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX1P22670 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX1P22670 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX1P22670 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX1P22670 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX1P22670 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX1P22670 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX1P22670 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX1P22670 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX1P22670 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX1P22670 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX1P22670 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX1P22670 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX1P22670 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX1P22670 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms