Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDHBP21953 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDHBP21953 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDHBP21953 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCKDHBP21953 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCKDHBP21953 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms