Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB4P17483 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXB4P17483 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB4P17483 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB4P17483 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXB4P17483 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms