Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNAP12004 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNAP12004 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNAP12004 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNAP12004 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNAP12004 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNAP12004 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNAP12004 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms