Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH10BP0C881 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH10BP0C881 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms