Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC6AO75865 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC6AO75865 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC6AO75865 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms