Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STX11O75558 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX11O75558 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX11O75558 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX11O75558 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STX11O75558 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STX11O75558 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX11O75558 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX11O75558 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX11O75558 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX11O75558 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX11O75558 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX11O75558 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms