Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCO2O43819 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCO2O43819 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCO2O43819 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCO2O43819 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCO2O43819 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCO2O43819 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms