Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX3YO15523 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX3YO15523 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX3YO15523 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms