Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C9orf92A6NGG3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf92A6NGG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms