Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC2BA2VCK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCDC2BA2VCK2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2BA2VCK2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms