Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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