Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms