Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB3Q9Y5E6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB3Q9Y5E6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB3Q9Y5E6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms