Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXBP1Q9Y5B6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXBP1Q9Y5B6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms