Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCTD3Q9Y597 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCTD3Q9Y597 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms