Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXND1Q9Y4D7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXND1Q9Y4D7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXND1Q9Y4D7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXND1Q9Y4D7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms