Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CEP164Q9UPV0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP164Q9UPV0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP164Q9UPV0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 562.1 ms