Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS11EQ9UL52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms