Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCTPQ9UKL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms