Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAPGEFL1Q9UHV5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEFL1Q9UHV5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 912.7 ms