Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
MLH3Q9UHC1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MLH3Q9UHC1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
MLH3Q9UHC1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms