Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRDQ9UH36 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRDQ9UH36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRDQ9UH36 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms