Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK2Q9UBU2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms