Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL9Q9P2J3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL9Q9P2J3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms