Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTEL1Q9NZ71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1Q9NZ71 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1Q9NZ71 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms