Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RDH8Q9NYR8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms