Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARS2Q9NP81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms