Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POPDC2Q9HBU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POPDC2Q9HBU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POPDC2Q9HBU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms