Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGQ9H9S0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms