Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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