Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms