Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms