Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPS25Q9BRG1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS25Q9BRG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms