Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF4Q9BQW3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF4Q9BQW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms