Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LITAFQ99732 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms