Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCLRE1CQ96SD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms