Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP4Q96PP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms