Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPOR3Q96MK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms