Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD1Q96JS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms