Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN3Q96D15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN3Q96D15 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms