Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC9Q92623 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms