Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOMQ8WWX9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms