Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DTX3LQ8TDB6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DTX3LQ8TDB6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms